clusterSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.clusterSeq

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见clusterSeq．

通过识别共表达模式对高通量测序数据进行聚类

Bioconductor版本:3.10

基于它们在多个(复制的)生物样本上的表达来鉴定共表达基因簇。

作者:Thomas J. Hardcastle & Irene Papatheodorou

维护者:Thomas J. Hardcastle

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("clusterSeq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“clusterSeq”)

PDF	R脚本	高级baySeq分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，MultipleComparison，测序，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 3.0.0)，方法，BiocParallel，baySeq，图形，统计，效用
进口	BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	clusterSeq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	clusterSeq_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	clusterSeq_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/clusterSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/clusterSeq/
软件包下载报告	下载数据