clusterProfiler

doi：10.18129/b9.bioc.clusterProfiler

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅clusterProfiler。

基因和基因簇功能曲线的统计分析和可视化

生物导体版本：3.10

该软件包实现了分析和可视化基因和基因簇的功能分布（GO和KEGG）的方法。

作者：广琴Yu [AUT，CRE，CPH]，Li-gen Wang [CTB]，Giovanni Dall'olio [CTB]（比较驱动器的公式接口）

维护者：gmail.com> guangchuang yu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ clusterProfiler”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ clusterProfiler”）

html	R脚本	基因和基因簇功能曲线的统计分析和可视化
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，聚类，，，，去，，，，基因烯，，，，kegg，，，，多重组合，，，，途径，，，，Reactome，，，，软件，，，，可视化
版本	3.14.3
在生物导体中	Bioc 2.8（R-2.13）（9年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.4.0）
进口	AnnotationDbi，，，，剂量（> = 3.5.1），富集（> = 0.99.7），GGPLOT2，，，，go.db，，，，Gosemsim，，，，马格里特， 方法，plyr，，，，QVALUE，，，，rvcheck，统计花花公子，UTILS
链接
建议	AnnotationHub，，，，dplyr，，，，kegg.db，，，，尼特，，，，org.hs.eg.db，，，，Prettydoc，，，，Reactomepa，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://guangchuangyu.github.io/software/clusterprofiler
BugReports	https://github.com/guangchuangyu/clusterprofiler/issues
取决于我	Maendtoend
进口我	生物加工者，，，，Cemitool，，，，达帕尔，，，，碎片器，，，，EEGC，，，，富集，，，，esatac，，，，FCOEX，，，，gdcrnatools，，，，林，，，，Mageckflute，，，，甲基，，，，mirsponger，，，，MOONLIGHTR，，，，recountworkflow，，，，rnaseqr，，，，SignaturesEarch，，，，tcgabiolinksgui，，，，tcgaworkflow
建议我	Chipseeker，，，，可乐，，，，剂量，，，，富集，，，，Epihet，，，，Gosemsim，，，，org.mxanthus.db，，，，Reactomepa，，，，SCGPS，，，，tcgabiolinks
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	clusterProfiler_3.14.3.tar.gz
Windows二进制	clusterProfiler_3.14.3.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	clusterProfiler_3.14.3.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterprofiler
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/clusterProfiler
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/clusterprofiler/
软件包下载报告	下载统计