簇发酵
doi：10.18129/b9.bioc.clusterexperiment
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅簇发酵。
比较单细胞测序的聚类
生物导体版本：3.10
提供了运行和比较单细胞测序数据或其他大型mRNA表达数据集的许多不同聚类的功能。
作者：Elizabeth Purdom [AUT，CRE，CPH]，Davide Risso [aut]
维护者：Elizabeth Purdom
引用（从r内，输入引用（“簇状”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ clusterexperiment”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ clusterexperiment”）
| html | R脚本 | 簇状插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件 |
| 版本 | 2.6.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（3.5岁） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，生物基因 |
| 进口 | 方法，NMF，，，，rcolorbrewer，，，，猿（> = 5.0），簇，统计林玛，，，，多少，，，，locfdr，，，，矩阵，图形，并行，rspectra，，，，克恩拉布，，，，Stringr，，，，S4VECTORS，grdevices，延迟（> = 0.7.48），HDF5Array（> = 1.7.10），矩阵，，，，RCPP，，，，EDGER，，，，秤，，，，Zinbwave，，，，门酶，，，，pracma |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，测试，，，，scrnaseq，，，，桅杆，，，，RTSNE，，，，斯克兰，，，，Igraph |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/epurdom/clusterexperiment/issues |
| 取决于我 | NetSmooth |
| 进口我 | Tradeseq |
| 建议我 | 弹弓 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | clusterexperiment_2.6.1.tar.gz |
| Windows二进制 | clusterexperiment_2.6.1.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | clusterexperiment_2.6.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterexperiment |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/clusterexperiment |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/clusterexperiment/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
