chromDraw

DOI:10.18129 / B9.bioc.chromDraw

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅chromDraw。

chromDraw R包图纸方案的分析在线性和循环的方式。

Bioconductor版本:3.10

ChromDraw是画的R包核型的方案(s)在线性和循环的方式。它可以可视化细胞遗传学marsk染色体。这个工具有自己的输入数据格式。从GenomicRanges输入数据可以导入数据结构。这个包可以可视化数据在床上文件格式。这是要求床的前九个字段格式。输出文件格式是*。每股收益和* .。

作者:Jan Janecka Ing。,经理CEITEC马萨里克大学

维护人员:1月Janecka < 1月。在ceitec.muni.cz janecka >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“chromDraw”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“chromDraw”)

PDF	R脚本	chromDraw
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	2.16.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.0)
进口	Rcpp(> = 0.11.1),GenomicRanges(> = 1.17.46)
链接	Rcpp
建议
SystemRequirements	Rtools (> = 3.1)
增强了
URL	www.plantcytogenomics.org/chromDraw
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	chromDraw_2.16.0.tar.gz
Windows二进制	chromDraw_2.16.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	chromDraw_2.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromDraw
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chromDraw
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chromDraw/
包下载报告	下载数据