chrogps
doi：10.18129/b9.bioc.chrogps
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅chrogps。
CHROGPS2：表观基因组图的产生，可视化和差分分析
生物导体版本：3.10
我们提供直观的地图，以根据其表观遗传学特征可视化，分析和比较遗传元素之间的关联。该方法基于多维缩放，并包括用于处理高维数据集的并行化实现。我们提供了几个明智的距离指标和调整程序，以消除在不同技术或遗传背景下获得的数据时通常观察到的系统偏见。我们还提供了在因子和基因水平上对表观基因组图进行差异分析的功能和方法。
作者：奥斯卡·雷纳（Oscar Reina），大卫·罗塞尔（David Rossell）
维护者：Oscar Reina
引用（从r内，输入引用（“ chrogps”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ chrogps”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Chrogps”）
| R脚本 | Chrogps库的手册 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，芯片，，，，聚类，，，，datarepresentation，，，，表观遗传学，，，，历史化，，，，免疫学，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 2.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（7。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2.14） |
| 要看 | r（> = 3.2.0），基因组机，，，，iranges， 方法，生物酶，，，，大量的，图形，统计信息，更改点 |
| 进口 | 簇，dppackage，ICSNP，，，，椭圆，，，，素食主义者 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行，XML，，，，RGL，，，，GPLOTS，，，，pheatmap，，，，Chippeakanno，，，，org.dm.eg.db，，，，表情，，，，情节 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | chrogps_2.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | chrogps_2.4.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | chrogps_2.4.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chrogps |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/chrogps |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chrogps/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
