Chipenrich

doi：10.18129/b9.bioc.chipenrich

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅Chipenrich。

CHIP-SEQ峰数据的基因集富集

生物导体版本：3.10

Chip-Enrich和Poly-Enrich使用来自ChIP-Seq实验的峰进行基因集富集测试。该方法从经验上纠正了混杂因素，例如基因的长度以及围绕基因序列的可摩擦性。

作者：Ryan P. Welch [Aut，CPH]，Chee Lee [Aut]，Raymond G. Cavalcante [Aut，Cre]，Chris Lee [Aut]，Laura J. Scott [THS]，Maureen A. Sartor [THS]

维护者：Raymond G. Cavalcante

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ chipenrich”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Chipenrich”）

html	R脚本	chipenrich_vignette
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	chipseq，，，，表观遗传学，，，，功能基因组学，，，，基因烯，，，，历史化，，，，免疫学，，，，回归，，，，软件
版本	2.10.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（6。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.4.0）
进口	AnnotationDbi，，，，生物基因，，，，chipenrich.data，，，，GenomeInfodB，，，，基因组机，grdevices，网格，iranges，，，，格子，，，，LatticeExtra，，，，大量的， 方法，MGCV，，，，org.dm.eg.db，，，，org.dr.eg.db，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，org.rn.eg.db， 平行，plyr，，，，RMS，，，，rtracklayer，，，，S4VECTORS（> = 0.23.10），统计Stringr，UTILS
链接
建议	生物使用，，，，DevTools，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，roxygen2，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	chipenrich_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	chipenrich_2.10.0.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	chipenrich_2.10.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipenrich
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/chipenrich
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipenrich/
软件包下载报告	下载统计