嵌合体

DOI:10.18129 / B9.bioc.chimera

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅嵌合体。

一个包融合产品的二次分析

Bioconductor版本:3.10

这个包可以促进融合产品的描述事件。它允许导入融合数据融合后的结果发现者:chimeraScan, bellerophontes,化解,FusionFinder, FusionHunter, mapSplice, tophat-fusion, FusionMap,明星,Rsubread fusionCatcher。

作者:拉斐尔Calogero,马特奥卡拉拉,Marco Beccuti弗朗西斯卡Cordero

维护人员:拉斐尔Calogero <拉斐尔。在unito.it calogero >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“嵌合体”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“嵌合体”)

PDF	R脚本	嵌合体
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施,软件
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(7年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase,GenomicRanges(> = 1.13.3),Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicAlignments、方法、AnnotationDbi,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,Homo.sapiens
进口
链接
建议	BiocParallel,geneplotter
SystemRequirements	明星,大礼帽,领结和samtools所需的一些功能
增强了	Rsubread,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene,Mus.musculus,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	chimera_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	chimera_1.27.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	chimera_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimera
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/妄想
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chimera/
包下载报告	下载数据