塞尔达
doi：10.18129/b9.bioc.celda
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅塞尔达。
蜂窝潜在的差异分配
生物导体版本：3.10
CELDA是一种贝叶斯分层模型，可以在单细胞测序数据中共同群集特征和细胞。
作者：Joshua Campbell [Aut，Cre]，Sean Corbett [aut]，Yusuke Koga [aut]，Shiyi Yang [aut]，Eric Reed [aut]，Zhe Wang [aut]
维护者：Joshua Campbell
引用（从r内，输入引用（“ Celda”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ celda”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Celda”）
| html | R脚本 | 用Celda分析单细胞RNA-seq计数数据 |
| html | R脚本 | 估计并从环境RNA中删除使用DeContx的SCRNA-SEQ数据的交叉污染 |
| html | R脚本 | 多类决策树的单细胞聚类结果的分类和注释 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 贝叶斯，，，，聚类，，，，基因表达，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件 |
| 版本 | 1.2.4 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（1年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | 统计，plyr，，，，foreach，，，，GGPLOT2，，，，rcolorbrewer， 网格，秤，，，，gtable，grdevices，图形，矩阵，，，，多帕尔，，，，消化，，，，栅格， 方法，RESHAPE2，，，，桅杆，，，，S4VECTORS，，，，Data.Table，，，，RCPP，，，，rcppeigen，，，，UWOT，，，，富集，，，，Stringi，，，，总结性特征，，，，McMcCrecision，，，，Ggrepel，，，，RTSNE，，，，用，，，，Dendextend，，，，ggdendro，，，，Proc，，，，马格里特 |
| 链接 | RCPP，，，，rcppeigen |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，roxygen2，，，，rmarkDown，，，，Corrplot，，，，矩阵，，，，Biomart，，，，COVR，，，，M3DEXAMPLEDATA，，，，生物管理器，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/campbio/celda/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Singlecelltk |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | celda_1.2.4.tar.gz |
| Windows二进制 | celda_1.2.4.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | celda_1.2.4.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/celda |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/celda |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/celda/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
