此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Breakpointr。
生物导体版本:3.10
该软件包实现了用于查找断点,绘制和导出链序列数据的功能。
作者:David Porubsky,Ashley Sanders,Aaron Taudt
维护者:David Porubsky
引用(从r内,输入引用(“ Breakpointr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ breakpointr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ breakpointr”)
R脚本 | 如何使用Breakpointr | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,dnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(1。5年) |
执照 | 文件执照 |
要看 | r(> = 3.6),基因组机,,,,牛仔图,,,,Breakpointrdata |
进口 | 方法,UTILS,GRDEVICES,Stats,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB(> = 1.12.3),iranges,,,,rsamtools,,,,基因组签名,,,,GGPLOT2,,,,生物基因,,,,gtools,,,,多帕尔,,,,foreach |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/daewoooo/breakpointr |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | breakpointr_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | breakpointr_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | breakpointr_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/breakpointr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/breakepointr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/breakpointr/ |
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