Breakpointr

doi:10.18129/b9.bioc.breakpointr

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Breakpointr

在Strand-Seq数据中查找断点

生物导体版本:3.10

该软件包实现了用于查找断点,绘制和导出链序列数据的功能。

作者:David Porubsky,Ashley Sanders,Aaron Taudt

维护者:David Porubsky

引用(从r内,输入引用(“ Breakpointr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ breakpointr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ breakpointr”)

PDF R脚本 如何使用Breakpointr
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,dnaseq,,,,测序,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1。5年)
执照 文件执照
要看 r(> = 3.6),基因组机,,,,牛仔图,,,,Breakpointrdata
进口 方法,UTILS,GRDEVICES,Stats,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB(> = 1.12.3),iranges,,,,rsamtools,,,,基因组签名,,,,GGPLOT2,,,,生物基因,,,,gtools,,,,多帕尔,,,,foreach
链接
建议 尼特,,,,生物使用,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/daewoooo/breakpointr
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 breakpointr_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 breakpointr_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) breakpointr_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/breakpointr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/breakepointr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/breakpointr/
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