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分歧点
DOI:10.18129 / B9.bioc.branchpointer
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见分歧点．
内含子剪接分支点的预测
Bioconductor版本:3.10
预测内含子分支点窗口中位点的分支点概率。查询可以作为内含子区域提供;或者评估突变的影响，snp。
作者:Beth Signal
维护者:Beth信号
引文(从R内，输入引用(“分歧点”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“分歧点”)
| R脚本 | 使用分支指针注释内含子人剪接分支点 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | GenomeAnnotation，GenomicVariation，MotifAnnotation，软件 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(3年) |
| 许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
| 取决于 | 脱字符号， r (>= 3.4) |
| 进口 | plyr，kernlab，“绿带运动”，stringr，cowplot，ggplot2，biomaRt，Biostrings，并行，utils，统计，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，rtracklayer，GenomicRanges，GenomeInfoDb，IRanges，S4Vectors，data.table |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | branchpointer_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | branchpointer_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | branchpointer_1.12.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/branchpointer |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/branchpointer/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
