bnbc

DOI:10.18129 / B9.bioc.bnbc

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见bnbc．

Hi-C数据的带向归一化和批量校正

Bioconductor版本:3.10

用于规范化来自副本的(几个)Hi-C数据的工具。

作者:Kipper Fletez-Brant [cre, aut]， Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Kipper Fletez-Brant

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bnbc")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“bnbc”)

超文本标记语言	R脚本	bnbc用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	嗝，归一化，预处理，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.4.0)，方法，BiocGenerics，SummarizedExperiment，GenomicRanges
进口	Rcpp(> = 0.12.12),IRanges，GenomeInfoDb，S4Vectors，matrixStats，preprocessCore，股东价值分析平行,EBImage,跑龙套
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hansenlab/bnbc
BugReports	https://github.com/hansenlab/bnbc/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	bnbc_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	bnbc_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	bnbc_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bnbc
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bnbc/
软件包下载报告	下载数据