bnbc

DOI:10.18129 / B9.bioc.bnbc

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见bnbc

Hi-C数据的带向归一化和批量校正

Bioconductor版本:3.10

用于规范化来自副本的(几个)Hi-C数据的工具。

作者:Kipper Fletez-Brant [cre, aut], Kasper Daniel Hansen [aut]

维护者:Kipper Fletez-Brant

引文(从R内,输入引用(“bnbc”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bnbc")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“bnbc”)

超文本标记语言 R脚本 bnbc用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 归一化预处理软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.4.0),方法,BiocGenericsSummarizedExperimentGenomicRanges
进口 Rcpp(> = 0.12.12),IRangesGenomeInfoDbS4VectorsmatrixStatspreprocessCore股东价值分析平行,EBImage,跑龙套
链接 Rcpp
建议 BiocStyleknitrrmarkdownRUnit
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/hansenlab/bnbc
BugReports https://github.com/hansenlab/bnbc/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 bnbc_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 bnbc_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) bnbc_1.8.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bnbc
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bnbc/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网