blacksheepr

DOI:10.18129 / B9.bioc.blacksheepr

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见blacksheepr．

两两差异比较的离群值分析

Bioconductor版本:3.10

Blacksheep是一种用于两两比较背景下的离群值分析的工具，旨在发现两个组之间的区别特征。该工具被设计用于生物应用，如磷蛋白组学或转录组学，但它可以用于任何可以用2D表表示的数据，并且在表中有两个亚种群进行比较。

作者:MacIntosh Cornwell [aut]， RugglesLab [cre]

维护:RugglesLab < RugglesLab at gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("blacksheep ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“blacksheepr”)

超文本标记语言	R脚本	用黑羊磷蛋白进行离群分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，测序，软件，转录，转录组
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6)
进口	grid, stats, grDevices, utils，circlize，冬青，RColorBrewer，ComplexHeatmap，SummarizedExperiment，pasilla
链接
建议	testthat(> =魅惑,knitr，BiocStyle，rmarkdown，旋度
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/ruggleslab/blackSheepR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	blacksheepr_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	blacksheepr_1.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	blacksheepr_1.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/blacksheepr
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/blacksheepr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/blacksheepr/
软件包下载报告	下载数据