birte

DOI:10.18129 / B9.bioc.birte

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.10版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅birte。

贝叶斯推理的监管影响表达式(biRte)

Bioconductor版本:3.10

信使rna分子的表达水平是由不同的过程,包括抑制或激活转录因子和转录后降解小分子核糖核酸。biRte使用TFs的监管网络,microrna可能还有其他因素,加上mRNA,以及其他可利用的microrna的表达数据预测的相对影响力监管者目标基因的表达。在贝叶斯推理完成使用Markov-Chain-Monte-Carlo建模框架。一个特殊特性是后续网络的可能性之间的反向工程活动监管机构。

作者:Holger Froehlich, Benedikt米基罗的贡献

维修工:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“birte”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯,GeneExpression,微阵列,网络,NetworkInference,回归,测序,软件,转录
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0.0),RcppArmadillo(> = 0.3.6.1),Rcpp
进口	质量,limma(> = 3.22.0),glmnet,Biobase,nem、图形数据,跑龙套
链接	RcppArmadillo,Rcpp
建议	knitr
SystemRequirements	布拉斯特区,LAPACK
增强了	Rgraphviz
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制	birte_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/birte
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ birte
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/birte/
包下载报告	下载数据