biotmle

DOI:10.18129 / B9.bioc.biotmle

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biotmle。

有针对性的学习与主持统计生物标志物的发现

Bioconductor版本:3.10

这个包促进了生物标志物的发现生物序列数据(例如,微阵列,RNA-seq)基于潜在生物标志物的联系与接触变量通过实现一个推理过程,结合了泛化的慢化统计目标最小损失的平均处理效应估计量的估计承认一个渐近线性表示(用一个有效的影响函数)。

赫亚兹作者:尼玛(cre, aut cph]艾伦·哈伯德(aut,黑色)黑色范德朗,马克(aut),Weixin Cai(施)

赫亚兹维护者:尼玛< nh nimahejazi.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biotmle”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biotmle”)

HTML	R脚本	从一个暴露变量标志物
HTML	R脚本	处理和分析RNA-Seq数据
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,测序,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(3年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 3.4)
进口	统计数据、方法dplyr,宠物猫,ggplot2,ggsci,过热,为了,未来,doFuture,tmle(> = 1.4.0.1),S4Vectors,BiocGenerics,BiocParallel,SummarizedExperiment,limma
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,地球,glmnet,randomForest,SuperLearner,矩阵,DBI,biotmleData(> = 1.1.1)
SystemRequirements
增强了
URL	https://code.nimahejazi.org/biotmle
BugReports	https://github.com/nhejazi/biotmle/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	biotmle_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	biotmle_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	biotmle_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biotmle
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biotmle
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biotmle/
包下载报告	下载数据