biomvRCNS

DOI:10.18129 / B9.bioc.biomvRCNS

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biomvRCNS。

拷贝数为多元生物数据研究和细分

Bioconductor版本:3.10

在这个包中,一个隐藏的半马尔可夫模型(软件)和一个均匀细分模型设计和实现分割基因组数据,目的是协助记录检测使用高通量技术如RNA-seq或瓷砖数组,并使用aCGH或序列拷贝数分析。

作者:杨杜

维护人员:杨Du < tooyoung gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biomvRCNS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biomvRCNS”)

PDF	R脚本	biomvRCNS方案介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,遗传学,微阵列,测序,软件,可视化,aCGH
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(7年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	IRanges,GenomicRanges,Gviz
进口	方法,mvtnorm
链接
建议	集群平行,GenomicFeatures,dynamicTreeCut,Rsamtools,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	biomvRCNS_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	biomvRCNS_1.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	biomvRCNS_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biomvRCNS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biomvRCNS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biomvRCNS/
包下载报告	下载数据