biobroom

DOI:10.18129 / B9.bioc.biobroom

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biobroom。

把Bioconductor对象变成整洁的数据帧

Bioconductor版本:3.10

这个包包含用于转换标准对象由生物信息学的方法包,尤其是Bioconductor,将他们整理数据。因此作为补充扫帚包,并遵循相同的整洁,增加反光整理分工方法。整理数据便于重组,重塑和可视化生物信息学分析。

作者:安德鲁j .鲈鱼,大卫·g·罗宾逊,史蒂夫•Lianoglou艾米丽·尼尔森,约翰·d·层,从劳伦与贡献

维修工:约翰·d·层< jstorey princeton.edu >和安德鲁j .低音< ajbass princeton.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biobroom”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biobroom”)

HTML	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(4.5年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 3.0.0),扫帚
进口	dplyr,tidyr,Biobase
链接
建议	limma,DESeq2,气道,ggplot2,plyr,GenomicRanges,testthat,magrittr,刨边机,qvalue,knitr,data.table,MSnbase,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/StoreyLab/biobroom
BugReports	https://github.com/StoreyLab/biobroom/issues
取决于我
进口我	泛太平洋伙伴关系
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	biobroom_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	biobroom_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	biobroom_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biobroom
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biobroom
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biobroom/
包下载报告	下载数据