biobroom

DOI:10.18129 / B9.bioc.biobroom

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biobroom

把Bioconductor对象变成整洁的数据帧

Bioconductor版本:3.10

这个包包含用于转换标准对象由生物信息学的方法包,尤其是Bioconductor,将他们整理数据。因此作为补充扫帚包,并遵循相同的整洁,增加反光整理分工方法。整理数据便于重组,重塑和可视化生物信息学分析。

作者:安德鲁j .鲈鱼,大卫·g·罗宾逊,史蒂夫•Lianoglou艾米丽·尼尔森,约翰·d·层,从劳伦与贡献

维修工:约翰·d·层< jstorey princeton.edu >和安德鲁j .低音< ajbass princeton.edu >

从内部引用(R,回车引用(“biobroom”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biobroom”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biobroom”)

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文本 新闻

细节

biocViews DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件
版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(4.5年)
许可证 LGPL
取决于 R (> = 3.0.0),扫帚
进口 dplyr,tidyr,Biobase
链接
建议 limma,DESeq2,气道,ggplot2,plyr,GenomicRanges,testthat,magrittr,刨边机,qvalue,knitr,data.table,MSnbase,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/StoreyLab/biobroom
BugReports https://github.com/StoreyLab/biobroom/issues
取决于我
进口我 泛太平洋伙伴关系
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 biobroom_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 biobroom_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) biobroom_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biobroom
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biobroom
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/biobroom/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网