bioCancer

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioCancer

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见bioCancer．

交互式多组学癌症数据可视化与分析

Bioconductor版本:3.10

bioCancer是一款可视化和交互式分析癌症基因组数据的多分析应用程序。

作者:Karim Mezhoud [aut, cre]

维护者:Karim Mezhoud

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bioCancer")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“bioCancer”)

超文本标记语言	R脚本	生物癌症:交互式多组学癌症数据可视化和分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation，GUI，GeneExpression，GeneTarget，MultipleComparison，网络，通路，Reactome，软件，可视化
版本	1.14.02
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	AGPL-3 |文件许可证
取决于	R (>= 3.5.0)，radiant.data(> = 1.0.6),cgdsr(> =)相对于1.2.6,XML(> = 3.99)
进口	闪亮的(> = 1.0.5),AlgDesign(> = 1.1.7.3),进口(>= 1.1.0)，方法shinythemes，Biobase，geNetClassifier，AnnotationFuncs，org.Hs.eg.db，剂量，clusterProfiler，reactome.db，ReactomePA，图(> = 1.0.5),visNetwork，htmlwidgets，plyr，宠物猫，DT(> = 0.12),dplyr(> = 0.8.5)
链接
建议	BiocStyle，rmarkdown，knitr，testthat(> = 0.10.0)
SystemRequirements
增强了
URL	http://kmezhoud.github.io/bioCancer
BugReports	https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	bioCancer_1.14.02.tar.gz
Windows二进制	bioCancer_1.14.02.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	bioCancer_1.14.02.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bioCancer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bioCancer/
软件包下载报告	下载数据