此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Bigmelon。
生物导体版本:3.10
使用GDSFMT使用Illumina阵列的方法。
作者:Tyler J. Gorrie-Stone [CRE,AUT],Ayden Saffari [AUT],Karim Malki [aut],Leonard C. Schalkwyk [aut]
维护者:泰勒·J·戈里·斯通(Tyler J. Gorrie-Stone)
引用(从r内,输入引用(“ Bigmelon”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bigmelon”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ BigMelon”)
R脚本 | BigMelon包 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,DataImport,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(3.5岁) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3),西瓜(> = 1.25.0),GDSFMT(> = 1.0.4),方法,Minfi(> = 1.21.0),生物酶,,,,甲基菌 |
进口 | 统计,utils,地球,图形,生物基因 |
链接 | |
建议 | 生物基因,,,,生物使用,,,,Minfidata, 平行,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19,,,,Bumphunter |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | bigmelon_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | bigmelon_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | bigmelon_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmelon |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/bigmelon |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bigmelon/ |
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