Bigmelon

doi:10.18129/b9.bioc.bigmelon

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Bigmelon

大型实验的Illumina甲基化阵列分析

生物导体版本:3.10

使用GDSFMT使用Illumina阵列的方法。

作者:Tyler J. Gorrie-Stone [CRE,AUT],Ayden Saffari [AUT],Karim Malki [aut],Leonard C. Schalkwyk [aut]

维护者:泰勒·J·戈里·斯通(Tyler J. Gorrie-Stone)

引用(从r内,输入引用(“ Bigmelon”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bigmelon”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ BigMelon”)

PDF R脚本 BigMelon包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,DataImport,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(3.5岁)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3),西瓜(> = 1.25.0),GDSFMT(> = 1.0.4),方法,Minfi(> = 1.21.0),生物酶,,,,甲基菌
进口 统计,utils,地球,图形,生物基因
链接
建议 生物基因,,,,生物使用,,,,Minfidata, 平行,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19,,,,Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b2.hg19,,,,Bumphunter
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bigmelon_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 bigmelon_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) bigmelon_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmelon
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/bigmelon
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bigmelon/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网