anota

DOI:10.18129 / B9.bioc.anota

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见anota

翻译活性分析(ANOTA)。

Bioconductor版本:3.10

全基因组转译控制研究正在成为研究各种生物学条件的工具。这种分析的输出是每个mRNA的mRNA水平(例如细胞质mRNA水平)和积极参与翻译的mRNA水平(积极翻译的mRNA水平)。此类数据的标准分析致力于识别两个或多个样本类别之间的差异翻译,即主动翻译mRNA水平的差异不依赖于细胞质mRNA水平的潜在差异。该软件包允许使用偏方差和随机方差模型进行这样的分析。当成千上万的mrna被并行分析时,文库会进行一些测试,以确保数据集适合这种分析。

作者:Ola Larsson < Ola。拉尔森在kiss .se>,Nahum Sonenberg , Robert Nadon

维护者:Ola Larsson < Ola。拉尔森在kiss .se>

引文(从R内,输入引用(“anota”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("anota")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“anota”)

PDF R脚本 翻译活性分析(anota)
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression微阵列测序软件
版本 1.34.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(9年)
许可证 GPL-3
取决于 qvalue
进口 qvalue
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 tRanslatome
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 anota_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 anota_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) anota_1.34.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/anota
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/anota
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/anota/
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