注释

DOI：10.18129 / b9.bioc.annotate.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅注释。

微阵列注释

生物导体版本：3.10

使用r Enviroments进行注释。

作者：r.绅士

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！procennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“annotate”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“annotate”）

PDF.	r script.	注释概述
PDF.	r script.	基本的使用
PDF.	r script.	HOWTO：获取HTML输出
PDF.	r script.	HOWTO：使用染色体信息
PDF.	r script.	HOWTO：使用在线查询工具
PDF.	r script.	使用Affymetrix探测级别数据
PDF.	r script.	使用数据包
PDF.	r script.	使用同源包
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	注解那去那途径那软件
版本	1.64.0
在生物导体中以来	BIOC 1.6（R-2.1）或更早版本（> 15年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 2.10），annotationdbi.（> = 1.27.5），XML.
进口	BioBase.那DBI.那xtable.，图形，实用程序，统计数据，方法，生物根系（> = 0.13.8），rcurl.
链接到
建议	hgu95av2.db.那Genefilter.那生物仪器（> = 2.25.10），绞喉那Rae230a.db.那Rae230aprobe.那TKWidgets.那go.db.那org.hs.eg.db.那org.mm.eg.db.那hom.hs.inp.db.那孵化器那rghrachviz那运行
系统要求
加强
URL.
取决于我	ChromheatMap.那Geneanswers.那Geneplotter.那GOSIM那GSEABASE.那Idiogram.那马特那MGFM.那雷尼卡那ml interfaces那Neve2006.那PCHENO.那现象那预先那predasampledata.那rpsixml.那sampleclassifier那scisi.那讽刺
进口我	咖啡店那类别那CompoundationCompare.那克那Codelink.那德布雷斯勒那药物潜行酶那GCMAP.那gcmapweb.那Geneanswers.那Genefilter.那Globalancova那全球化境那古司裤那lumi.那甲烷分析那弥撒那MGFR.那pathwaysplice.那现象那QPGraph..那ReportingTools.那scisi.那剪接那Systempiper.那蒂格雷
建议我	Adme16cod.db.那ag.db.那ATH1121501.DB.那Bioccasestudies.那生物根系那生物雕那Bovine.DB.那canine.db.那canine2.db.那celegans.db.那Chicken.DB.那clariomdhumanprobeset.db.那clariomdhumantranscriptcluster.db.那clariomshumanhttranscriptcluster.db.那clariomshumantranscriptcluster.db.那clariomsmousehttranscriptcluster.db.那clariomsmousetranscriptcluster.db.那clariomsrathttranscriptcluster.db.那clariomsrattranscriptcluster.db.那drosgenome1.db.那果蝇2.db.那Ecoli2.dB.那Genomicranges.那gghumanmethcancerpanelv1.db.那GSAR.那GSEALM那h10kcod.db.那H20KCOD.DB.那hcg110.db.那hgfocus.db.那hgu133a.db.那hgu133a2.db.那hgu133b.db.那hgu133plus2.db.那hgu219.db.那hgu95a.db.那hgu95av2.db.那hgu95b.db.那hgu95c.db.那hgu95d.db.那hgu95e.db.那hguatlas13k.db.那hgubeta7.db.那hgudkfz31.db.那hgug4100a.db.那hgug4101a.db.那hgug4110b.db.那hgug4111a.db.那hgug4112a.db.那hgug4845a.db.那Hguqiagenv3.db.那hi16cod.db.那HMDBQuery.那hs25kresogen.db.那hs6ug171.db.那hsagilentdesign026652.db.那hta20probeset.db.那hta20transcript cluster.db.那hthgu133a.db.那hthgu133b.db.那hu35ksuba.db.那hu35ksubb.db.那hu35ksubc.db.那hu35ksubd.db.那hu6800.db.那huex10stprobeset.db.那huex10sttranscriptcluster.db.那hugene10stprobeset.db.那hugene10sttranscript cluster.db.那hugene11stprobeset.db.那hugene11sttranscriptcluster.db.那hugene20stprobeset.db.那hugene20sttranscriptcluster.db.那hugene21stprobeset.db.那hugene21sttranscriptcluster.db.那HUO22.DB.那hwgcod.db.那Illuminahumanmethylation27k.db.那illiminahumanv1.db.那illiminahumanv2.db.那illuminahumanv2beadid.db.那illuminahumanv3.db.那illiminahumanv4.db.那illuminahumanwgdaslv3.db.那illuminahumanwgdaslv4.db.那Illuminamousev1.db.那Illuminamousev1p1p1.db.那Illuminamousev2.db.那Illuminaratv1.db.那Indac.DB.那jazaerimetadata.db.那lapointe.db.那lumihumanall.db.那lumimouseall.db.那lumiratall.db.那m10kcod.db.那m20kcod.db.那maigespack.那MetagenomeSQ.那mgu74a.db.那mgu74av2.db.那mgu74b.db.那mgu74bv2.db.那mgu74c.db.那mgu74cv2.db.那mguatlas5k.db.那mgug4104a.db.那mgug4120a.db.那mgug4121a.db.那mgug4122a.db.那mi16cod.db.那mirbaseversions.db.那MLP.那mm24kresogen.db.那mmagilentdesign026655.db.那moe430a.db.那moe430b.db.那moex10stprobeset.db.那moex10sttranscriptcluster.db.那mogene10stprobeset.db.那mogene10sttranscriptcluster.db.那mogene11stprobeset.db.那mogene11sttranscriptcluster.db.那mogene20stprobeset.db.那mogene20sttranscriptcluster.db.那mogene21stprobeset.db.那mogene21sttranscriptcluster.db.那mouse4302.db.那mouse430a2.db.那mpedbarray.db.那mta10probeset.db.那mta10transcript cluster.db.那mu11ksuba.db.那mu11ksubb.db.那mu15v1.db.那mu19ksuba.db.那mu19ksubb.db.那mu19ksubc.db.那mu22v3.db.那mwgcod.db.那挪威981.db.那nugohs1a520180.db.那nugomm1a520177.db.那operonhumanv3.db.那org.ag.eg.db.那org.at.tair.db.那org.bt.eg.db.那org.ce.eg.db.那org.cf.eg.db.那org.dm.eg.db.那org.dr.eg.db.那org.eck12.eg.db.那org.ecsakai.eg.db.那org.gg.eg.db.那org.hs.eg.db.那org.mm.eg.db.那org.mmu.eg.db.那org.pf.plasmo.db.那org.pt.eg.db.那org.rn.eg.db.那org.sc.sgd.db.那org.ss.eg.db.那org.xl.eg.db.那partheenmetadata.db.那PCXN.那pedbarrayv10.db.那pedbarrayv9.db.那pocrcannotation.db.那porcine.db.那彪马那r10kcod.db.那Rae230a.db.那Rae230b.db.那raex10stprobeset.db.那raex10sttranscriptcluster.db.那ragene10stprobeset.db.那ragene10sttranscriptcluster.db.那ragene11stprobeset.db.那ragene11sttranscriptcluster.db.那ragene20stprobeset.db.那ragene20sttranscriptcluster.db.那ragene21stprobeset.db.那ragene21sttranscriptcluster.db.那rat2302.db.那rgu34a.db.那rgu34b.db.那rgu34c.db.那Rguatlas4k.db.那rgug4105a.db.那rgug4130a.db.那rgug4131a.db.那RI16COD.DB.那rnagilentdesign028282.db.那rnbeads.那rnu34.db.那Roberts2005Annotation.db.那RTA10Probeset.dB.那RTA10TranscriptCluster.db.那RTU34.DB.那rwgcod.db.那shdz.db.那siggenes.那概括分析那U133x3p.db.那xlaevis.db.那yeast2.db.那YGS98.DB.那Zebrafish.DB.
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包档案包

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源包	annotate_1.64.0.tar.gz.
Windows二进制文件	annotate_1.64.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	annotate_1.64.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/annotate.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/注释
包短网址	https://biocumon.org/packages/annotate/
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