alevinQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.alevinQC

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见alevinQC．

为Alevin输出生成QC报告

Bioconductor版本:3.10

生成总结alevin运行输出的QC报告。报表可以以html或pdf文件的形式生成，也可以以闪亮的应用程序的形式生成。

作者:Charlotte Soneson [aut, cre]，阿维·斯里瓦斯塔瓦[au]

维护者:Charlotte Soneson

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("alevinQC")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“alevinQC”)

超文本标记语言	R脚本	alevinQC
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	质量控制，SingleCell，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(1年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6)
进口	rmarkdown，工具，方法，ggplot2，GGally，dplyr，rjson，闪亮的，shinydashboard，DT，统计，utils，tximport(> = 1.11.5),cowplot
链接
建议	knitr，BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/csoneson/alevinQC
BugReports	https://github.com/csoneson/alevinQC/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	alevinQC_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	alevinQC_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	alevinQC_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinQC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/alevinQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/alevinQC/
软件包下载报告	下载数据