affycoretools

DOI:10.18129 / B9.bioc.affycoretools

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见affycoretools．

函数有用的那些做重复分析与Affymetrix基因芯片

Bioconductor版本:3.10

编写了各种包装函数，以简化核心生物统计学家可能看到的更常见的分析。

作者:詹姆斯·w·麦克唐纳

维护者:James W. MacDonald

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“affycoretools”)

超文本标记语言	R脚本	使用\Biocpkg{affycoretools}和ReportingTools创建带注释的输出
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，微阵列，OneChannel，ReportWriting，软件
版本	1.58.4
Bioconductor自	BioC 1.8 (R-2.3)(14年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase、方法
进口	affy，limma，GOstats，gcrma样条函数,xtable，AnnotationDbi，ggplot2，gplots，oligoClasses，ReportingTools，hwriter，晶格，S4Vectors，刨边机，RSQLite，BiocGenerics，DBI，Glimma
链接
建议	affydata，hgfocuscdf，BiocStyle，knitr，hgu95av2.db，rgl，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AgiMicroRna
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	affycoretools_1.58.4.tar.gz
Windows二进制	affycoretools_1.58.4.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	affycoretools_1.58.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affycoretools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affycoretools/
包下载报告	下载数据