此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyILM.
Bioconductor版本:3.10
affyILM是一种预处理工具,用于估计Affymetrix基因芯片的基因表达水平。从物理化学的输入被用于第一个背景减去强度,然后计算浓度代表朗缪尔模型。
作者:K.米利亚姆·克罗尔,法布里斯·伯杰,杰拉德·巴科马,恩里科·卡隆
维护者:米里亚姆·克罗尔和法布里斯·伯格<法布里斯。伯格在gmail.com>
引用(从R中,输入引用(“affyILM”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“affyILM”)
R脚本 | affyILM1.3.0 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,预处理,软件 |
版本 | 1.38.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.6 (R-2.11)(10年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(>= 2.10.0),方法,gcrma |
进口 | affxparser(> = 1.16.0),affy、图形、Biobase |
链接 | |
建议 | AffymetrixDataTestFiles,hgfocusprobe |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | affyILM_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | affyILM_1.38.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | affyILM_1.38.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/affyILM |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affyILM |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/affyILM/ |
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