affyILM

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyILM

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyILM

背景减法的线性模型与朗缪尔等温线

Bioconductor版本:3.10

affyILM是一种预处理工具,用于估计Affymetrix基因芯片的基因表达水平。从物理化学的输入被用于第一个背景减去强度,然后计算浓度代表朗缪尔模型。

作者:K.米利亚姆·克罗尔,法布里斯·伯杰,杰拉德·巴科马,恩里科·卡隆

维护者:米里亚姆·克罗尔和法布里斯·伯格<法布里斯。伯格在gmail.com>

引用(从R中,输入引用(“affyILM”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“affyILM”)

PDF R脚本 affyILM1.3.0
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel预处理软件
版本 1.38.0
在Bioconductor公司 BioC 2.6 (R-2.11)(10年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 2.10.0),方法,gcrma
进口 affxparser(> = 1.16.0),affy、图形、Biobase
链接
建议 AffymetrixDataTestFileshgfocusprobe
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 affyILM_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 affyILM_1.38.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) affyILM_1.38.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/affyILM
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affyILM
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affyILM/
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