affy
DOI:
10.18129 / B9.bioc.affy
这个包是3.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本，请参见affy。
Affymetrix寡核苷酸阵列的方法
Bioconductor版本:3.10
该包包含的功能，以探索寡核苷酸阵列分析。对tkWidgets的依赖只涉及几个方便的函数。“affy”没有它是完全功能的。
作者:Rafael A. Irizarry ， Laurent Gautier ， Benjamin Milo Bolstad ， Crispin Miller 与来自Magnus Astrand ， Leslie M. Cope < Cope at mts.jhu.edu>， Robert Gentleman, Jeff Gentry, Conrad halalling < challening at agilixcorp.com>， Wolfgang Huber, James MacDonald ， Benjamin i.p. Rubinstein, Christopher Workman < Workman at cbs.dtu。dk >,约翰
维护者:Rafael A. Irizarry
安装
要安装此包，请启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install("affy")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“affy”)
细节
| biocViews |
微阵列,OneChannel,预处理,软件 |
| 版本 |
1.64.0 |
| Bioconductor自 |
BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15年) |
| 许可证 |
LGPL (> = 2.0) |
| 取决于 |
R (> = 2.8.0),BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase(> = 2.5.5) |
| 进口 |
affyio(> = 1.13.3),BiocManager、图形、grDevices、方法、preprocessCore,统计,跑龙套,zlibbioc |
| 链接 |
preprocessCore |
| 建议 |
tkWidgets(> = 1.19.0),affydata,widgetTools |
| SystemRequirements |
|
| 增强了 |
|
| URL |
|
| 取决于我 |
affyContam,affydata,AffyExpress,affyPara,affypdnn,affyPLM,affyQCReport,AffyRNADegradation,AgiMicroRna,ALLMLL,altcdfenvs,AmpAffyExample,arrayMvout,ArrayTools,bgx,bronchialIL13,ccTutorial,ChimpHumanBrainData,慢性淋巴细胞白血病,Cormotif,curatedBladderData,curatedOvarianData,DrugVsDisease,dualKS,ecoliLeucine,ExiMiR,农场,frmaTools,gcrma,Hiiragi2013,LMGene,logitT,maPredictDSC,MAQCsubset,MAQCsubsetAFX,maskBAD,中长期规划,mvoutData,panp,plw,prebs,PREDAsampledata,qpcrNorm,RefPlus,Risa,战,扫描。通用产品,simpleaffy,SpikeIn,SpikeInSubset,sscore,斯塔尔,webbioc,XhybCasneuf |
| 进口我 |
affycoretools,affyILM,affylmGUI,affyQCReport,arrayQualityMetrics,ArrayTools,咖啡馆,ChIPXpress,coexnet,Cormotif,crossmeta,DeSousa2013,Doscheda,天哪,农场,ffpe,frma,gcrma,GEOsubmission,Harshlight,HTqPCR,iCheck,光民,LVSmiRNA,makecdfenv,mimager,MSnbase,PECA,钳子,plw,彪马,pvac,rat2302frmavecs,rCGH,Rnits,signatureSearchData,simpleaffy,STATegRa,tilingArray,TurboNorm,vsn,waveTiling |
| 建议我 |
AnnotationForge,ArrayExpress,数组,beadarray,beadarraySNP,BiocCaseStudies,BiocGenerics,Biostrings,BufferedMatrixMethods,categoryCompare,ecolitk,雌激素,ExpressionView,factDesign,ffpeExampleData,gCMAPWeb,GeneRegionScan,limma,made4,paxtoolsr,钢琴,PREDA,qcmetrics,runibic,siggenes,TCGAbiolinks |
| 我的链接 |
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| 构建报告 |
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