adductomicsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.adductomicsR

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅adductomicsR。

adductomic质量光谱数据集的处理

Bioconductor版本:3.10

流程一份数据来识别潜在的加合物肽从光谱已经纠正了大规模漂移和保留时间漂移和量化MS1质量光谱的峰值水平。

作者:乔西海耶斯< jlhayes1982 gmail.com >

维修工:乔西海耶斯< jlhayes1982 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“adductomicsR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“adductomicsR”)

HTML	R脚本	Adductomics工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,GUI,MassSpectrometry,代谢组学,软件,ThirdPartyClient
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6),adductData,ExperimentHub,AnnotationHub
进口	平行(> = 3.3.2),data.table(> = 1.10.4),OrgMassSpecR(> = 0.4.6),foreach(> = 3),mzR(> = 2.14.0),ade4(> = 1.7.6),房车(> = 0.3.2),pastecs(> = 1.3.18),reshape2(> = 1.4.2),pracma(> = 2.0.4),DT(> = 0.2),fpc(> = 2.1.10),doSNOW(> = 1.0.14),fastcluster(> = 1.1.22),RcppEigen(> = 0.3.3.3.0),引导(> = 2017.2),平滑(> = 1.1),dplyr(> = 0.7.5),动物园(> = 1.8),数据(> = 3.5.0),跑龙套(> = 3.5.0),图形(> = 3.5.0),grDevices(> = 3.5.0)、方法(> = 3.5.0),数据集(> = 3.5.0)
链接
建议	knitr(> = 1.15.1),rmarkdown(> = 1.5),Rdisop(> = 1.34.0),testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/JosieLHayes/adductomicsR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	adductomicsR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	adductomicsR_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	adductomicsR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adductomicsR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ adductomicsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/adductomicsR/
包下载报告	下载数据