此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见aCGH.
Bioconductor版本:3.10
从图像分析输出文件和克隆信息文件中读取aCGH数据的函数,创建用于存储这些数据的aCGH S3对象。访问/替换、子集、打印和绘制aCGH对象的基本方法。
作者:Jane Fridlyand
维护者:Peter Dimitrov < Dimitrov at stat.Berkeley.EDU>
引文(从R内,输入引用(“aCGH”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("aCGH")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“aCGH”)
R脚本 | aCGH概述 | |
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariation,DataImport,遗传学,软件 |
版本 | 1.64.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10),集群,生存,乘 |
进口 | Biobase,集群, grDevices,图形,方法,乘统计数据,生存,样条,utils |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | CRImage |
进口我 | ADaCGH2,rCGH,snapCGH |
建议我 | beadarraySNP |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | aCGH_1.64.0.tar.gz |
Windows二进制 | aCGH_1.64.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | aCGH_1.64.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/aCGH |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/aCGH |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/aCGH/ |
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