yapsa
doi：10.18129/b9.bioc.yapsa
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅yapsa。
还有另一个用于签名分析的软件包
生物导体版本：3.10
该软件包提供了有用的功能和例程，可用于分析躯体特征（参见L. Alexandrov等人，自然2013）。特别是，提供了具有已知特征（LCD =线性组合分解）的签名分析的功能，并提供了对分层突变目录（SMC =分层突变目录）的签名分析。
作者：Daniel Huebschmann，Zuguang Gu，Matthias Schlesner
维护者：Daniel Huebschmann
引用（从r内，输入引用（“ Yapsa”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ yapsa”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Yapsa”）
| html | R脚本 | yapsa |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 生物问题，，，，聚类，，，，dnaseq，，，，基因组变量，，，，测序，，，，软件，，，，somaticmmut，，，，统计信息，，，，可视化 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（3.5岁） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.3.0），基因组机，，，，GGPLOT2， 网格 |
| 进口 | lsei，，，，躯体签名，，，，变体，，，，GenomeInfodB，，，，RESHAPE2，，，，栅格，，，，Corrplot，，，，Dendextend，，，，getoptlong，，，，循环，，，，Gtrellis，，，，PMCMR，，，，复杂的图像，，，，keggrest，grdevices |
| 链接 | |
| 建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | yapsa_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | yapsa_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | yapsa_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yapsa |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/yapsa |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/yapsa/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
