Ularcirc

doi:10.18129/b9.bioc.ullcirc

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Ularcirc

用于规范和背部剪接分析的闪亮应用程序(即圆形和mRNA分析)

生物导体版本:3.10

ULARCIRC在星形对齐的剪接连接文件中读取,并提供可视化和分析工具用于剪接分析。用户可以评估后置路口和前进典型连接。

作者:David Humphreys [AUT,CRE]

维护者:David Humphreys

引用(从r内,输入引用(“ ularcirc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ularcirc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ ularcirc”)

html R脚本 Ularcirc
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 替代方案,,,,注解,,,,覆盖范围,,,,datarepresentation,,,,差速器,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1。5年)
执照 文件执照
要看 R(> = 3.4.0)
进口 AnnotationHub,,,,AnnotationDbi,,,,生物基因,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,Data.Table(> = 1.9.4),DT,,,,GenomicFeatures,,,,GenomeInfodB,,,,GenomeInfodBdata,,,,基因组签名,,,,基因组机,,,,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,gsubfn,,,,mirbase.db,,,,时刻,,,,有机体,,,,S4VECTORS,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,光泽,,,,Shinyjs,,,,寿司,,,,Yaml
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,生物使用,,,,httpuv,,,,尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,rmarkDown,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ularcirc_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 ularcirc_1.4.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ularcirc_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ularcirc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ularcirc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ularcirc/
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