此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见三硝基甲苯.
Bioconductor版本:3.10
TnT javascript库(https://github.com/ tntvis)的R接口,提供基于轨迹的基因组数据的交互式和灵活的可视化。
作者:Jialin Ma [cre, aut], Miguel Pignatelli [aut], Toby Hocking [aut]
维护者:Jialin Ma
引文(从R内,输入引用(TnT)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TnT")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (TnT)
超文本标记语言 | R脚本 | TnT简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,软件,可视化 |
版本 | 1.8.1 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年) |
许可证 | AGPL-3 |
取决于 | R (>= 3.4),GenomicRanges |
进口 | 方法,统计,utils, grDevices,htmlwidgets,jsonlite,data.table,Biobase,GenomeInfoDb,IRanges,S4Vectors,knitr |
链接 | |
建议 | GenomicFeatures,闪亮的,BiocManager,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/Marlin-Na/TnT |
BugReports | https://github.com/Marlin-Na/TnT/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | TnT_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | TnT_1.8.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | TnT_1.8.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TnT |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TnT |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TnT/ |
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