此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅吐司。
生物导体版本:3.10
该软件包致力于分析复杂组织中的高通量数据(例如基因表达微阵列,DNA甲基化微阵列,RNA-SEQ)。当前功能包括1.检测细胞类型特异性或跨细胞类型差异信号2.改善无参考反卷积的变量选择。
作者:Ziyi Li和Hao Wu
维护者:ziyi li
引用(从r内,输入引用(“吐司”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ toast”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“吐司”)
html | R脚本 | Toast用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,差异性,,,,差甲基化,,,,表观遗传学,,,,基因表达,,,,遗传学,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(<6个月) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.6),Reffreeewas,,,,繁殖 |
进口 | 统计,方法,总结性特征 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,CSSAM,,,,GPLOTS,,,,矩阵,,,,矩阵 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/ziyili20/toast/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | toast_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | toast_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | toast_1.0.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/toast |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/吐司 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/toast/ |
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