TFARM

DOI:10.18129 / B9.bioc.TFARM

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TFARM

转录因子关联规则

Bioconductor版本:3.10

它搜索相关协会的转录因子,转录因子的目标,在特定基因组区域。它还允许评估的重要性指数分布转录因子和转录因子的组合关联规则。

作者:Liuba娜乌西卡马蒂诺,爱丽丝Parodi,盖亚Ceddia, Piercesare西奇,斯特凡诺Campaner,马可Masseroli

维护人员:Liuba娜乌西卡马蒂诺< liuban。马蒂诺在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“TFARM”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TFARM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TFARM”)

PDF R脚本 转录因子关联规则
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BiologicalQuestion,基础设施,软件,StatisticalMethod,转录
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(2.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.4)
进口 arules,字段,GenomicRanges、图形、stringr、方法、统计数据gplots
链接
建议 BiocStyle,knitr,plyr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 TFARM_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 TFARM_1.8.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) TFARM_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFARM
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TFARM
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TFARM/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网