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TFARM
DOI:10.18129 / B9.bioc.TFARM
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TFARM。
转录因子关联规则
Bioconductor版本:3.10
它搜索相关协会的转录因子,转录因子的目标,在特定基因组区域。它还允许评估的重要性指数分布转录因子和转录因子的组合关联规则。
作者:Liuba娜乌西卡马蒂诺,爱丽丝Parodi,盖亚Ceddia, Piercesare西奇,斯特凡诺Campaner,马可Masseroli
维护人员:Liuba娜乌西卡马蒂诺< liuban。马蒂诺在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“TFARM”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TFARM”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TFARM”)
| R脚本 | 转录因子关联规则 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiologicalQuestion,基础设施,软件,StatisticalMethod,转录 |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(2.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | arules,字段,GenomicRanges、图形、stringr、方法、统计数据gplots |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,plyr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | TFARM_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TFARM_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | TFARM_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFARM |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TFARM |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TFARM/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
