tdaracne

doi:10.18129/b9.bioc.tdaracne

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅tdaracne

网络反向工程从时间课程数据。

生物导体版本:3.10

从时间序列测量中推断基因网络是生物信息学研究领域的当前挑战。为了检测不同时间延迟基因之间的依赖性,我们提出了一种方法,从基于信息理论的众所周知的算法开始,从时间序列测量中推断基因调节网络。预计该算法有助于从时间课程数据中重建小型生物学定向网络。

作者:Zoppoli P.,Morganella S.,Ceccarelli M.

维护者:zoppoli pietro

引用(从r内,输入引用(“ tdaracne”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tdaracne”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Tdaracne”)

PDF R脚本 tdaracne
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,软件,,,,时间科
版本 1.36.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(9年)
执照 GPL-2
要看 Genkern,,,,rgraphviz,,,,生物酶
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源包 tdaracne_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 tdaracne_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) tdaracne_1.36.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tdaracne
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tdaracne
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tdaracne/
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