TCseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.TCseq

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TCseq。

时间进程测序数据分析

Bioconductor版本:3.10

定量和微分外遗传性和转录组时间序列数据的分析、聚类分析和可视化的数据时间的课程模式。

作者:吴Mengjun < minervajunjun gmail.com >, Lei顾< leigu broadinstitute.org >

维护人员:吴Mengjun < minervajunjun gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TCseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TCseq”)

PDF	R脚本	TCseq装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,聚类,DifferentialExpression,表观遗传学,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,可视化
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4)
进口	刨边机,BiocGenerics,reshape2,GenomicRanges,IRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments,Rsamtools,e1071,集群,ggplot2、网格、grDevices统计,跑龙套,方法,locfit
链接
建议	testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TCseq_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	TCseq_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	TCseq_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TCseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TCseq/
包下载报告	下载数据