此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Synmut。
生物导体版本:3.10
对使用特定的二核苷酸或密码子组成设计病毒突变体的需求越来越多。该工具可以在设计突变体时考虑二核苷酸的偏好和/或密码子使用偏置。它是DNA序列突变体的硅设计中的强大工具。
作者:Haogao Gu [AUT,CRE],Leo L.M. Poon [LED]
维护者:haogao gu
引用(从r内,输入引用(“ synmut”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ sannmut”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ synmut”)
html | R脚本 | Synmut:设计DNA序列的同义突变体 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 实验设计,,,,预处理,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(1年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | |
进口 | seqinr, 方法,生物弦,,,,Stringr,,,,生物基因 |
链接 | |
建议 | 生物管理器,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,DevTools,,,,Prettydoc,,,,胶水 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/koohoko/synmut |
BugReports | https://github.com/koohoko/synmut/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | synmut_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | synmut_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | synmut_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synmut |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/sannmut |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/synmut/ |
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