Synmut

doi:10.18129/b9.bioc.synmut

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Synmut

Synmut:设计具有不同基因组特征的同义突变序列

生物导体版本:3.10

对使用特定的二核苷酸或密码子组成设计病毒突变体的需求越来越多。该工具可以在设计突变体时考虑二核苷酸的偏好和/或密码子使用偏置。它是DNA序列突变体的硅设计中的强大工具。

作者:Haogao Gu [AUT,CRE],Leo L.M. Poon [LED]

维护者:haogao gu

引用(从r内,输入引用(“ synmut”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ sannmut”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ synmut”)

html R脚本 Synmut:设计DNA序列的同义突变体
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验设计,,,,预处理,,,,测序,,,,软件
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(1年)
执照 GPL-2
要看
进口 seqinr, 方法,生物弦,,,,Stringr,,,,生物基因
链接
建议 生物管理器,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,DevTools,,,,Prettydoc,,,,胶水
系统要求
增强
URL https://github.com/koohoko/synmut
BugReports https://github.com/koohoko/synmut/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 synmut_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 synmut_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) synmut_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synmut
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/sannmut
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/synmut/
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