总结性特征

doi：10.18129/b9.bioc.summarizedExperiment

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅总结性特征。

汇总experiment容器

生物导体版本：3.10

汇总experiment容器包含一个或多个测定法，每个测定都由数字或其他模式的矩阵状对象表示。行通常代表感兴趣的基因组范围，列代表样本。

作者：马丁·摩根（Martin Morgan），Valerie Obenchain，Jim Hester，HervéPagès

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ summariziedexperiment”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

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browsevignettes（“总结性特征”）

html	R脚本	1.总结了协调实验测定，样本和感兴趣区域的特殊性
html	R脚本	2.扩展摘要的表演课
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，覆盖范围，，，，遗传学，，，，基因数，，，，基础设施，，，，测序，，，，软件
版本	1.16.1
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（4。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.2），方法，基因组机（> = 1.33.6），生物酶，，，，延迟（> = 0.3.20）
进口	UTIT，统计，工具，矩阵，，，，生物基因（> = 0.15.3），S4VECTORS（> = 0.23.20），iranges（> = 2.13.16），GenomeInfodB（> = 1.13.1）
链接
建议	注释，，，，AnnotationDbi，，，，HGU95AV2.DB，，，，GenomicFeatures，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，消化，，，，jsonlite，，，，RHDF5，，，，HDF5Array（> = 1.7.5），呼吸道，，，，运行，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我	辅助，，，，呼吸道，，，，等位基因平衡，，，，Aspediafi，，，，BDMMACORCT，，，，Benchmarkfdrdata2019，，，，Biocsklearn，，，，Biseq，，，，BNBC，，，，Bodymaprat，，，，BSSEQ，，，，Cagefightr，，，，Celaref，，，，簇发酵，，，，Coseq，，，，CSAW，，，，策展adipochip，，，，策展人，，，，达米尔塞克，，，，装饰，，，，Deepsnv，，，，demixt，，，，deseq2，，，，dexseq，，，，差异，，，，diffcoepp，，，，Diffhic，，，，发散，，，，DMCFB，，，，dmchmm，，，，dmrcate，，，，Dream4，，，，DSQTL，，，，enmix，，，，富集兄弟，，，，Epgenomix，，，，评估，，，，EventPointer，，，，表达，，，，裂变，，，，flowsorted.blood.epic，，，，Flowsorted.cordbloodcombined.450k，，，，Genogam，，，，基因组签名，，，，Genomicfiles，，，，Genoset，，，，Geuvpack，，，，Grmetrics，，，，GSEABENCHMARKER，，，，hdcytodata，，，，Helloranges，，，，Hipathia，，，，HMP16SDATA，，，，iggenusage，，，，intad，，，，互动集，，，，兴趣，，，，我明白，，，，Isomirs，，，，春日，，，，接口，，，，lipidr，，，，loomexpermiment，，，，mbased，，，，metagxbreast，，，，Metagxovarian，，，，Methrix，，，，甲基管，，，，microRNAOME，，，，Minfi，，，，Mirmine，，，，mpra，，，，多亚sayExexperiment，，，，NADFINDER，，，，nbamseq，，，，校长，，，，甲状旁腺，，，，Powerexplorer，，，，profileplyr，，，，叙事，，，，REMP，，，，安息，，，，休息，，，，Ripseeker，，，，RQT，，，，runibic，，，，SampleClalsifierData，，，，比例4C，，，，SCGPS，，，，烤饼，，，，SDAMS，，，，sgseq，，，，SignaturesEarch，，，，Simulatorz，，，，Singlecellexperiment，，，，Singlecelltk，，，，辛格，，，，soggi，，，，西班牙猎狗，，，，Sracipe，，，，SSPATHS，，，，斯塔格，，，，总结，，，，幸存，，，，次级表演，，，，Tissueenrich，，，，tnbc.cms，，，，香草，，，，变体，，，，variantexperiment，，，，山药，，，，Zinbwave
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链接到我
构建报告

包装档案

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源包	SummarizedExperiment_1.16.1.tar.gz
Windows二进制	总结Exexperiment_1.16.1.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	总结Exexperiment_1.16.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/summarizeexperiment
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/摘要excperiment
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/summarizeexperiment/
软件包下载报告	下载统计