SpeCond

DOI:10.18129 / B9.bioc.SpeCond

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SpeCond。

条件表达式的具体检测数据

Bioconductor版本:3.10

这个包执行基因表达数据分析来检测condition-specific基因。这样明显上升或下调基因在一个小数量的条件。它是通过拟合的混合正态分布表达式的值。条件可以是环境条件,不同组织、器官或任何其他来源,你想比较基因表达。

作者:佛罗伦萨卡瓦利

维护人员:佛罗伦萨卡瓦利<佛罗伦萨在ebi.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SpeCond”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SpeCond”)

PDF	R脚本	SpeCond
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparison,ReportWriting,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(10.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.0),mclust(> = 3.3.1),Biobase(> = 1.15.13),字段,hwriter(> = 1.1),RColorBrewer、方法
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SpeCond_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	SpeCond_1.40.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SpeCond_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpeCond
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SpeCond
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SpeCond/
包下载报告	下载数据