猎犬
DOI:10.18129 / B9.bioc.Spaniel
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见猎犬．
空间转录组学分析
Bioconductor版本:3.10
Spaniel包括一系列工具来帮助空间转录组数据的质量控制和分析。该包包含从计数矩阵和空间条形码文件创建Seurat对象或singlecel实验的函数，并提供了将组织学图像加载到r中的方法。spanielPlot函数允许将包含在S4对象中的指标可视化覆盖到组织图像上。
作者:瑞秋·奎恩<瑞秋。纽卡斯尔女王>
维护者:Rachel Queen < Rachel。纽卡斯尔女王>
引文(从R内，输入引用(“猎犬”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Spaniel")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“猎犬”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 使用猎犬 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 聚类，报道，DataImport，DataRepresentation，GeneExpression，基础设施，归一化，预处理，质量控制，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组，可视化 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，修拉，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，dplyr |
| 进口 | 方法,ggplot2，嘘(> = 1.13.27),闪亮的，jpeg，magrittr跑龙套,S4Vectors |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，testthat，devtools |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Spaniel_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Spaniel_1.0.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Spaniel_1.0.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Spaniel |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Spaniel |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Spaniel/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
