躯体签名
doi：10.18129/b9.bioc.somaticsignatures
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅躯体签名。
躯体签名
生物导体版本：3.10
体积签名包可以确定单核苷酸变体（SNV）的突变特征。它提供了与Nik-Zainal（2012，细胞）中描述的方法相关的基础架构，并具有矩阵分解算法的灵活性。
作者：朱利安·盖林（Julian Gehring）
维护者：julian gehring
引用（从r内，输入引用（“ somaticsignatures”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ somaticSignatures”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ somaticsignatures”）
| html | R脚本 | 躯体签名 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，基因组变量，，，，测序，，，，软件，，，，somaticmmut，，，，统计信息，，，，可视化 |
| 版本 | 2.22.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（6年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.1.0），变体，，，，基因组机，，，，NMF |
| 进口 | S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，生物弦，，，，GGPLOT2，，，，GGBIO，，，，RESHAPE2，，，，NMF，，，，pcamethods，，，，生物酶， 方法，代理人 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特， 平行，bsgenome.hsapiens.1000genomes.hs37d5，，，，somaticccanceralterations，，，，ggdendro，，，，Fastica，，，，SVA |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/juliangehring/somaticsignatures |
| BugReports | https://support.bioconductor.org |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 稀有，，，，yapsa |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | somaticsignatures_2.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | somaticsignatures_2.22.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | somaticsignatures_2.22.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/somaticsignatures |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/somaticsignatures |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/somaticsignatures/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
