SeqVarTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqVarTools

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SeqVarTools．

用于不同数据的工具

Bioconductor版本:3.10

SeqArray中提供的VCF数据快速访问存储格式的接口，以及用于常见操作和分析的工具。

作者:Stephanie M. Gogarten，郑秀文，Adrienne Stilp

维护者:Stephanie M. Gogarten

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SeqVarTools")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SeqVarTools”)

PDF	R脚本	SeqVarTools简介
PDF	R脚本	SeqVarTools中的迭代器
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability，遗传学，单核苷酸多态性，测序，软件
版本	1.24.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6.5年)
许可证	GPL-3
取决于	SeqArray
进口	grDevices，图形，统计，方法，Biobase，gdsfmt，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，GWASExactHW，logistf，矩阵，dplyr，rlang，tidyr
链接
建议	BiocGenerics，BiocStyle，RUnit，stringr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/smgogarten/SeqVarTools
全靠我
进口我	《创世纪》，VariantExperiment
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SeqVarTools_1.24.1.tar.gz
Windows二进制	SeqVarTools_1.24.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SeqVarTools_1.24.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SeqVarTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SeqVarTools/
软件包下载报告	下载数据