SVAPLSSEQ

doi:10.18129/b9.bioc.svaplsseq

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅SVAPLSSEQ

SVAPLSSEQ-AN R软件包估算不良变异性的隐藏因素,并适应它们,以基于RNASEQ数据启用更强大,更准确的差分表达分析

生物导体版本:3.10

该软件包包含旨在提取RNASEQ数据中潜在变化的签名的函数,并使用它们对两个指定生物组之间的一组特征(基因,转录本)进行改进的差异表达分析。

作者:Sutirtha Chakraborty

维护者:yahoo.co.in>的Sutirtha Chakraborty

引用(从r内,输入引用(“ svaplsseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ svaplsseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ svaplsseq”)

PDF R脚本 SVAPLSSEQ教程
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 批处理效应,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,正常化,,,,rnaseq,,,,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(3.5岁)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.4)
进口 方法,统计,总结性特征,,,,EDGER,,,,GGPLOT2,,,,林玛,,,,lmtest, 平行,
链接
建议 生物使用
系统要求
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取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 svaplsseq_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 svaplsseq_1.12.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) svaplsseq_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/svaplsseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/svaplsseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/svaplsseq/
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