STROMA4

DOI:10.18129 / B9.bioc.STROMA4

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅STROMA4

TNBC患者分配属性

Bioconductor版本:3.10

这个包估计四TNBC患者基质性质确定每个病人的基因表达数据集。这些基质财产分配可以结合亚型患者。这四种基质性质被确定在三阴乳腺癌(TNBC)患者和代表的存在不同的细胞间质:T细胞(T), B细胞(B),间质浸润上皮细胞(E)和粘连形成(D)。另外这个包也可以用来估计生成属性莱曼亚型,另一种TNBC子类型化方案(PMID: 21633166)。

作者:Sadiq萨利赫(aut (cre),迈克尔·哈雷特(aut)

维护人员:Sadiq萨利赫< Sadiq。在mail.mcgill.ca mehdiismailsaleh >

从内部引用(R,回车引用(“STROMA4”)):

安装

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“STROMA4”)

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文档

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PDF R脚本 使用STROMA4包
PDF 参考手册

细节

biocViews BiomedicalInformatics,分类,GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,RNASeq,软件
版本 1.10.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(3年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.4),Biobase,BiocParallel,集群,matrixStats、统计数据、图形,跑龙套
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包档案

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源包 STROMA4_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 STROMA4_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) STROMA4_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/STROMA4
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ STROMA4
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/STROMA4/
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