这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅STRINGdb。
Bioconductor版本:3.10
STRINGdb包提供了一个R界面到字符串蛋白质相互作用数据库(http://www.string-db.org)。
作者:安德里亚•弗兰切斯基尼< andrea.franceschini在isb-sib.ch >
维护人员:达米安Szklarczyk <达米安。在imls.uzh.ch szklarczyk >
从内部引用(R,回车引用(“STRINGdb”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“STRINGdb”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“STRINGdb”)
R脚本 | STRINGdb装饰图案 | |
参考手册 |
biocViews | 网络,软件 |
版本 | 1.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(6.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 2.14.0) |
进口 | png,sqldf,plyr,igraph,RCurl、方法、RColorBrewer,gplots,哈希,plotrix |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | PPInfer,scsR |
进口我 | coexnet,glmSparseNet,IMMAN,pwOmics,日坛,XINA |
建议我 | epiNEM,GeneNetworkBuilder,netSmooth,PCAN |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | STRINGdb_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | STRINGdb_1.26.0.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | STRINGdb_1.26.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/STRINGdb |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ STRINGdb |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/STRINGdb/ |
包下载报告 | 下载数据 |