分裂

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见分裂

文本的拼接解释器

Bioconductor版本:3.10

提供工具来分析替代剪接位点,根据序列信息解释结果,选择和设计引物进行位点验证,并给出事件的可视化表示,以指导下游实验。

作者:Diana Low [aut, cre]

维护者:Diana Low

引文(从R内,输入引用(“分裂”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SPLINTER")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“分裂”)

PDF R脚本 分裂
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingGeneExpressionImmunoOncologyRNASeq软件可视化
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.6.0), grDevices, stats
进口 图形,ggplot2seqLogoBiostringsbiomaRtGenomicAlignmentsGenomicRangesGenomicFeaturesGvizIRangesS4VectorsGenomeInfoDb跑龙套,plyrstringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9googleVis
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/dianalow/SPLINTER/
BugReports https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SPLINTER_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 SPLINTER_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) SPLINTER_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SPLINTER
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网