分裂
DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见分裂．
文本的拼接解释器
Bioconductor版本:3.10
提供工具来分析替代剪接位点，根据序列信息解释结果，选择和设计引物进行位点验证，并给出事件的可视化表示，以指导下游实验。
作者:Diana Low [aut, cre]
维护者:Diana Low
引文(从R内，输入引用(“分裂”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SPLINTER")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“分裂”)
| R脚本 | 分裂 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，软件，可视化 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 3.6.0)， grDevices, stats |
| 进口 | 图形,ggplot2，seqLogo，Biostrings，biomaRt，GenomicAlignments，GenomicRanges，GenomicFeatures，Gviz，IRanges，S4Vectors，GenomeInfoDb跑龙套,plyr，stringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，googleVis |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/dianalow/SPLINTER/ |
| BugReports | https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | SPLINTER_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SPLINTER_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | SPLINTER_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SPLINTER |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
