SAGx

DOI:10.18129 / B9.bioc.SAGx

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SAGx。

GeneChip的统计分析

Bioconductor版本:3.10

检索的包,准备和分析数据从Affymetrix GeneChip。特别是识别差异表达基因的问题解决。

作者:每Broberg

维护人员:每Broberg <π。在gmail.com broberg >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SAGx”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SAGx”)

PDF	R脚本	samroc——示例
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,KEGG,微阵列,MultipleComparison,OneChannel,通路,预处理,回归,软件
版本	1.60.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (r - 2.4)(13.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 2.5.0),统计数据,乘、方法
进口	Biobase,stats4
链接
建议	KEGG.db,hu6800.db,质量
SystemRequirements
增强了
URL	http://home.swipnet.se/pibroberg/expression_hemsida1.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SAGx_1.60.0.tar.gz
Windows二进制	SAGx_1.60.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SAGx_1.60.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SAGx
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SAGx
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SAGx/
包下载报告	下载数据