rsamtools
doi：10.18129/b9.bioc.rsamtools
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅rsamtools。
二进制对齐（BAM），FASTA，变体调用（BCF）和Tabix文件导入
生物导体版本：3.10
该软件包提供了用于操纵SAM（序列对齐 / MAP），FASTA，二进制变体呼叫（BCF）和压缩索引索引索引Tab-Delimimited（TABIX）文件的“ Samtools”，“ BCFTools”和“ Tabix”实用程序的接口。
作者：马丁·摩根（Martin Morgan），赫尔夫（Herv）
维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用（从r内，输入引用（“ rsamtools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rsamtools”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ RSAMTOOLS”）
| R脚本 | RSAMTOOLS介绍 | |
| R脚本 | 使用samtools c库 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 | |
| 视频 | 在rsamtools中堆积 |
细节
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rsamtools_2.2.3.3.tar.gz |
| Windows二进制 | rsamtools_2.2.3.3.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | rsamtools_2.2.2.3.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rsamtools |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rsamtools |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rsamtools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
