Risa

DOI:10.18129 / B9.bioc.Risa

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Risa

从ISA-tab试验元数据转换成Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:3.10

调查/研究/试验(ISA)一样格式是一个通用的框架来收集和交流复杂的元数据(即样本特征、技术类型的测量)从实验中采用的组合技术,从传统的高通量方法技术。在ISA-Tab Risa允许访问元数据/数据格式和构建Bioconductor数据结构。目前,数据来自微阵列、流式细胞术和metabolomics-based支持(即质谱)分析。包是可扩展的和正在努力支持元数据相关的蛋白质组学分析。

作者:Alejandra Gonzalez-Beltran,奥黛丽•考夫曼Steffen Neumann加布里埃尔Rustici, ISA团队

维护人员:Alejandra Gonzalez-Beltran < alejandra.gonzalez。——gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(Risa)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(Risa)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF R脚本 Risa:从ISA-tab试验元数据转换成Bioconductor数据结构
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释,DataImport,MassSpectrometry,软件
版本 1.28.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (r - 2.15)(7.5年)
许可证 LGPL
取决于 R (> = 2.0.9),Biobase(> =测试盒框)、方法Rcpp(> = 0.9.13),biocViews,affy
进口 xcms
链接
建议 faahKO(> = 1.2.11)
SystemRequirements
增强了
URL http://www.isa-tools.org/
BugReports https://github.com/ISA-tools/Risa/issues
取决于我
进口我
建议我 mtbls2
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 Risa_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 Risa_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) Risa_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Risa
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Risa
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Risa/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网