林戈

doi：10.18129/b9.bioc.ringo

此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅林戈。

R调查芯片芯片寡聚架

生物导体版本：3.10

包装铃声促进了芯片芯片数据的主要分析。包装的主要功能是数据读数，质量评估，数据可视化和基因组区域的识别，显示了CHIP-CHIP中的富集。该软件包具有处理芯片芯片项目中使用的Nimblegen的两色寡核苷酸微阵列的功能，但鉴于数据以RGLIST（RGLIST（RAW）或expressionset（pre-pre-pre-predionset）提供（pre-pre-prectionset）（pre-chip-chip数据分析）（pre-chip-chip数据分析）（处理）。该软件包采用了来自生物导体项目的其他各种软件包的功能，并提供了其他芯片芯片特异性和敏捷特异性功能。

作者：Joern Toedling，Oleg Sklyar，Tammo Krueger，Matt Ritchie，Wolfgang Huber

维护者：J。Toedling

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ringo”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Ringo”）

PDF	R脚本	r对敏捷寡聚的调查
PDF		参考手册

细节

生物浏览	DataImport，，，，微阵列，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，软件，，，，两通道
版本	1.50.0
在生物导体中	Bioc 2.0（R-2.5）（13年）
执照	艺术2.0
要看	方法，生物酶（> = 1.14.1），rcolorbrewer，，，，林玛，，，，矩阵， 网格，格子
进口	生物基因（> = 0.1.11），GeneFilter，，，，林玛，，，，VSN，Stats4
链接
建议	rtracklayer（> = 1.3.1），mclust，，，，topgo（> = 1.15.0）
系统要求
增强
URL
取决于我	CCTORIAL，，，，simbindprofiles，，，，斯塔尔
进口我	repitools
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ringo_1.50.0.tar.gz
Windows二进制	ringo_1.50.0.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	ringo_1.50.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ringo
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/林戈
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/ringo/
软件包下载报告	下载统计