此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见红色的.
Bioconductor版本:3.10
RedeR是一个基于r的包,结合了一个独立的Java应用程序,用于模块化结构、嵌套网络和多层层次关联的交互式可视化和操作。
作者:Mauro Castro, Wang Xin, Florian Markowetz
维护者:Mauro Castro < Mauro .a.。卡斯特罗在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“红”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" reader ")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“红”)
超文本标记语言 | R脚本 | RedeR:分层网络表示 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,GraphAndNetwork,基础设施,网络,软件,可视化 |
版本 | 1.34.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(8.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 3.3.3),方法 |
进口 | igraph |
链接 | |
建议 | pvclust,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | Java运行时环境(>= 6) |
增强了 | |
URL | http://genomebiology.com/2012/13/4/R29 |
全靠我 | Fletcher2013b |
进口我 | Mulder2012,PANR,研制,transcriptogramer |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | RedeR_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | RedeR_1.34.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RedeR_1.34.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RedeR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RedeR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RedeR/ |
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