红色的

DOI:10.18129 / B9.bioc.RedeR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见红色的

交互式可视化和嵌套网络的操作

Bioconductor版本:3.10

RedeR是一个基于r的包,结合了一个独立的Java应用程序,用于模块化结构、嵌套网络和多层层次关联的交互式可视化和操作。

作者:Mauro Castro, Wang Xin, Florian Markowetz

维护者:Mauro Castro < Mauro .a.。卡斯特罗在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“红”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" reader ")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“红”)

超文本标记语言 R脚本 RedeR:分层网络表示
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentationGraphAndNetwork基础设施网络软件可视化
版本 1.34.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(8.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.3.3),方法
进口 igraph
链接
建议 pvclustBiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements Java运行时环境(>= 6)
增强了
URL http://genomebiology.com/2012/13/4/R29
全靠我 Fletcher2013b
进口我 Mulder2012PANR研制transcriptogramer
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RedeR_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 RedeR_1.34.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) RedeR_1.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RedeR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RedeR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RedeR/
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Bioconductor

R/凹口包和文档

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网