RCWLPIPELINE

doi:10.18129/b9.bioc.rcwlpipelines

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅RCWLPIPELINE

基于RCWL的生物信息学管道

生物导体版本:3.10

基于R和通用工作流语言的生物信息学工具和管道的集合。

作者:Qiang Hu [AUT,CRE],Shuang Gao [aut]

维护者:qiang hu

引用(从r内,输入引用(“ rcwlpipelines”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rcwlpipelines”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rcwlpipelines”)

html R脚本 RCWL管道
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,dnaseq,,,,DataImport,,,,免疫学,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,工作流程
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(1年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.6),rcwl,,,,Biocfilecache
进口 dplyr,,,,Rappdirs,,,,jsonlite,方法,utils,tximport
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求 nodejs
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rcwlpipelines_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan) rcwlpipelines_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcwlpipelines
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rcwlpipelines
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rcwlpipelines/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网