此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅RCWLPIPELINE。
生物导体版本:3.10
基于R和通用工作流语言的生物信息学工具和管道的集合。
作者:Qiang Hu [AUT,CRE],Shuang Gao [aut]
维护者:qiang hu
引用(从r内,输入引用(“ rcwlpipelines”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rcwlpipelines”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rcwlpipelines”)
html | R脚本 | RCWL管道 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,dnaseq,,,,DataImport,,,,免疫学,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,工作流程 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(1年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.6),rcwl,,,,Biocfilecache |
进口 | dplyr,,,,Rappdirs,,,,jsonlite,方法,utils,tximport |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | nodejs |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rcwlpipelines_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rcwlpipelines_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcwlpipelines |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rcwlpipelines |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rcwlpipelines/ |
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