此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见旅游房车.
Bioconductor版本:3.10
罕见变异共享(RVS)实现了在家族样本中罕见遗传变异基因型和二分表型(例如疾病状态)之间的关联和联系的测试。这些测试是基于稀有变异与表型之间不存在联系和关联的原假设下亲属间共享稀有变异的概率,适用于一个地区的单个变异或多个变异(例如基于基因的测试)。
作者:Alexandre Bureau, Ingo Ruczinski, Samuel Younkin, Thomas Sherman
维护者:Thomas Sherman
引文(从R内,输入引用(“旅游房车”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RVS")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“旅游房车”)
超文本标记语言 | R脚本 | RVS套装 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExomeSeq,遗传学,GenomeWideAssociation,ImmunoOncology,软件,VariantDetection,WholeGenome |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | GENLIB,粮食,snpStats,kinship2,方法,统计,utils |
链接 | |
建议 | knitr,testthat,rmarkdown,BiocStyle,VariantAnnotation |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | RVS_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | RVS_1.8.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RVS_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RVS |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RVS |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RVS/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |